MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 6185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	AGGG	2	8	59	66	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008578	GAC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008578	ATC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008578	AGCTG	2	10	1711	1720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008578	AC	3	6	1726	1731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008578	GTC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008578	ATGACG	2	12	1757	1768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008578	CAC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008578	TGCC	2	8	1838	1845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008578	CAGG	2	8	1907	1914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008578	ACG	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008578	GCT	2	6	4835	4840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008578	GCG	2	6	4882	4887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008578	GCG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008578	GGA	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008578	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008578	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008578	AGC	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008578	CGG	2	6	9537	9542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008578	CGGT	2	8	9550	9557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008578	TCC	2	6	10171	10176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008578	GA	3	6	10194	10199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008578	CTC	2	6	10221	10226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008578	CGG	2	6	10263	10268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008578	GC	3	6	10271	10276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008578	CG	4	8	10277	10284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008578	GAA	2	6	10287	10292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008578	GAA	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008578	GGTC	2	8	10356	10363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008578	CGG	3	9	10449	10457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008578	GGC	2	6	10470	10475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008578	GGCG	2	8	10502	10509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008578	CGC	2	6	10545	10550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008578	CAG	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008578	AGT	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008578	CGA	2	6	11311	11316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008578	CGA	3	9	11319	11327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008578	GGT	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008578	GTCC	2	8	12046	12053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008578	GGC	2	6	12094	12099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008578	TCG	2	6	12146	12151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008578	GCG	2	6	12169	12174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008578	GCC	2	6	12189	12194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008578	CGG	2	6	12742	12747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008578	CGG	2	6	12761	12766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008578	CGC	2	6	12800	12805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008578	TCG	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008578	CG	3	6	14298	14303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008578	CG	3	6	14324	14329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008578	CGG	2	6	14687	14692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008578	GCC	2	6	14797	14802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008578	CGGC	2	8	16607	16614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008578	CGGC	2	8	16638	16645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008578	GCCG	2	8	16659	16666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008578	GAC	2	6	16677	16682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008578	GTC	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008578	CCT	2	6	24547	24552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008578	CGGCTT	2	12	24558	24569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008578	CTG	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008578	GTT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008578	GT	3	6	24738	24743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008578	C	6	6	24768	24773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_008578	CAC	2	6	24779	24784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008578	TCT	2	6	29254	29259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008578	CGG	2	6	29333	29338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008578	GCG	2	6	29380	29385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008578	GCC	2	6	29412	29417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008578	CCTTT	2	10	29444	29453	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008578	GCC	2	6	29515	29520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008578	GCC	2	6	29543	29548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008578	GCT	2	6	29559	29564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008578	CAG	2	6	29621	29626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008578	GCC	2	6	29657	29662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008578	CCG	2	6	29689	29694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008578	CTGG	2	8	29712	29719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008578	TCCA	2	8	29740	29747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008578	CCG	2	6	29750	29755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008578	GC	3	6	29766	29771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008578	CG	4	8	29774	29781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008578	TG	3	6	30421	30426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008578	GAG	2	6	30437	30442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008578	CAG	2	6	30461	30466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008578	CG	3	6	30543	30548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008578	CCT	2	6	31549	31554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008578	GCCG	2	8	31602	31609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008578	GCC	2	6	31637	31642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008578	ACG	2	6	31658	31663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008578	CGC	2	6	31712	31717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008578	ACC	2	6	31737	31742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008578	CCT	2	6	35912	35917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008578	CCGG	2	8	35924	35931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008578	ACG	2	6	38055	38060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008578	CGG	2	6	38098	38103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008578	GCC	2	6	38127	38132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008578	GTC	2	6	38182	38187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008578	CCA	3	9	38202	38210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008578	CCA	2	6	38227	38232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008578	CGC	2	6	38324	38329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008578	GCT	2	6	39116	39121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008578	AGG	2	6	39222	39227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008578	GGT	2	6	39243	39248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008578	GTCA	2	8	39337	39344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008578	GTC	2	6	40557	40562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008578	GGC	2	6	40588	40593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008578	GCG	2	6	40637	40642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008578	GCCG	2	8	40662	40669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008578	GCG	2	6	40711	40716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008578	GCG	2	6	40753	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008578	CGT	2	6	40760	40765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008578	GCT	2	6	40776	40781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008578	GC	3	6	40786	40791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008578	GC	3	6	40827	40832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008578	GCCGGC	2	12	40941	40952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008578	CGG	2	6	40953	40958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008578	GCG	2	6	40981	40986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008578	GC	3	6	41146	41151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008578	TG	3	6	41179	41184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008578	GTC	2	6	41274	41279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008578	TC	3	6	41281	41286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008578	GC	3	6	41287	41292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008578	TC	3	6	41295	41300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008578	CATG	2	8	42320	42327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008578	GCC	2	6	42333	42338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008578	GAC	2	6	42339	42344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008578	TTC	2	6	42352	42357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008578	CGCC	2	8	42365	42372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_008578	CAA	2	6	43858	43863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008578	CAA	2	6	43909	43914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008578	GACA	2	8	43947	43954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008578	TC	4	8	43963	43970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008578	CG	3	6	44028	44033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008578	TCA	2	6	44063	44068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008578	TAA	2	6	44132	44137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008578	GCG	2	6	44160	44165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008578	GT	3	6	44183	44188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008578	CAG	2	6	44207	44212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008578	CGG	2	6	44213	44218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008578	ATC	2	6	44254	44259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008578	CCG	2	6	44761	44766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008578	AC	3	6	44793	44798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008578	CCA	2	6	44827	44832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008578	CGC	2	6	44846	44851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008578	TCG	2	6	45517	45522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008578	CGTACA	2	12	45622	45633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008578	CT	3	6	47447	47452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008578	GTC	2	6	47471	47476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008578	GCCG	2	8	47501	47508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008578	AGC	2	6	47532	47537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008578	GCG	3	9	48033	48041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008578	CCA	2	6	48047	48052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_008578	GCG	2	6	48056	48061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008578	TCGCT	2	10	48111	48120	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_008578	GCA	2	6	48124	48129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008578	CAC	2	6	49092	49097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_008578	GTCG	2	8	51034	51041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_008578	GGT	2	6	51081	51086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008578	CAC	2	6	52960	52965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_008578	CGGGA	2	10	52976	52985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_008578	ACG	2	6	52987	52992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008578	CCGT	2	8	54252	54259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_008578	TGCC	2	8	54322	54329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_008578	TCG	2	6	57092	57097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_008578	TG	3	6	57164	57169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_008578	GCC	2	6	59053	59058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
171	NC_008578	CGG	2	6	59121	59126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_008578	GC	3	6	62402	62407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
179	NC_008578	CCG	2	6	62425	62430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_008578	CGG	3	9	63859	63867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_008578	ATCCG	2	10	92125	92134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_008578	CG	3	6	92133	92138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
272	NC_008578	GCT	2	6	92145	92150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_008578	GGA	2	6	93444	93449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_008578	GTC	2	6	100816	100821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_008578	TGC	2	6	100862	100867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_008578	CG	4	8	100893	100900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_008578	GAC	2	6	100934	100939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_008578	TCG	2	6	100971	100976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_008578	GCG	2	6	142139	142144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_008578	GC	3	6	143287	143292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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425	NC_008578	GCG	2	6	145592	145597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_008578	ATC	2	6	145613	145618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_008578	ACC	2	6	145631	145636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_008578	GCTTG	2	10	145640	145649	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
429	NC_008578	ATC	2	6	145650	145655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_008578	CGG	2	6	150370	150375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_008578	CCGG	2	8	150428	150435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_008578	CGG	2	6	151717	151722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_008578	GTG	2	6	151867	151872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_008578	GCA	2	6	151960	151965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_008578	ACC	2	6	151980	151985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_008578	GTG	2	6	152071	152076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_008578	CGG	2	6	152080	152085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_008578	CGC	2	6	153398	153403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_008578	CGT	2	6	153416	153421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_008578	GTG	2	6	153580	153585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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